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Ágios Ioánnis est une localité dans la commune de Ágios Vasílios, dans le district régional de Réthymnon, dans la périphérie de Crète, en Grèce. Ágios Ioánnis se situe dans le massif Lefka Ori, sur l'île de Crete. Sa population est de 51 habitants (2021). La grande ville la plus proche est Réthymnon, à 16,5 km au nord-est. Plages à proximité : de Skinos (4,7 km), Plakias (4,9 km), Plakias (5,4 km). Parmi les sites touristiques alentour : Monastère d'Arkadi (23 km), Monastère de Préveli (9,9 km) et Eléftherna (28 km). Parmi les sites naturels : Grotte de Patsós (15,3 km) et Cave of Melidoni (34 km).