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Margarítes est une localité dans la commune de Mylopótamos, dans le district régional de Réthymnon, dans la périphérie de Crète, en Grèce. Margarítes se situe à 300 m d'altitude, au pied du massif Crete, sur l'île de Crete. Sa population est de 267 habitants (2021). La grande ville la plus proche est Réthymnon, à 19,6 km à l'ouest. Plages à proximité : Spilies (9 km), Geropotamos (9,1 km), Livadi (12 km). Parmi les sites touristiques alentour : Eléftherna (1,2 km), Monastère d'Arkadi (6,1 km) et Phaistos (34 km). Parmi les sites naturels : Cave of Melidoni (6,4 km) et Grotte de Zeus (19,5 km).