Varnutė est un village dans Municipalité du district de Jonava, dans Apskritis de Kaunas, en Lituanie. Varnutė se situe à 79 m d'altitude. La grande ville la plus proche est Jonava, à 2,5 km au sud-est. Parmi les sites touristiques alentour : Neuvième Fort (30 km), Musée national d'art Mikalojus-Konstantinas-Čiurlionis (31 km) et Monastère de Pažaislis (28 km). Parmi les sites naturels : Vainiai poplar (4,4 km).