Pavyžupys est un village dans la municipalité de Kalvarija, dans Apskritis de Marijampolė, en Lituanie. Pavyžupys se situe à 150 m d'altitude. Sa population est de 5 habitants. La grande ville la plus proche est Marijampolė, à 25 km au nord-est. Parmi les sites touristiques alentour : Puńsk synagogue (16,1 km), Church of the Assumption in Puńsk (16,2 km) et Our Lady of Częstochowa church in Becejły (13,8 km).

Aussi écrit Pavyžupys.